二，青苔中伴生或者寄生著某種、甚至多重未知的微生物。

    因此徐云他們做的第一件事，便是確定青苔凈化能力的來(lái)源。

    十五分鐘后。

    周佩瑤從電子顯微鏡上抬起頭，對(duì)徐云道：

    “徐神，我核對(duì)了foc和華夏植物志，青苔從形態(tài)上符合常見(jiàn)的水生類苔蘚。”

    “另外基因的its也測(cè)出來(lái)了，沒(méi)有變異?ài)E象，可以斷定它不是新物種，自身不存在凈化能力?！?/br>
    徐云面色平靜的點(diǎn)了點(diǎn)頭。

    周佩瑤的實(shí)驗(yàn)結(jié)果很明了，直接排除了第一種可能性。

    因此具備潔凈效果的，應(yīng)該就是青苔中存在的某種微生物了。

    這個(gè)答案并不意外。

    目前地球上已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的微生物——包括細(xì)菌、真菌、藻類等在內(nèi)，總數(shù)大約有兩百多萬(wàn)。

    至于未被發(fā)現(xiàn)的數(shù)量就更多了，并且波動(dòng)很大。

    眾所周知。

    目前推測(cè)生物種數(shù)一共有兩類方法：

    一類是直接請(qǐng)分類學(xué)專家通過(guò)理論推算，評(píng)估世界上可能還有多少物種待發(fā)現(xiàn)。

    另一類方法是根據(jù)已詳細(xì)調(diào)查區(qū)域的物種數(shù)量，外推至全球的總物種數(shù)。

    然而，這些方法有許多假設(shè)與限制，使得推算的總物種數(shù)差異甚大。

    最低的推算數(shù)值是三百萬(wàn)，最高的甚至達(dá)到了一個(gè)億。

    目前接受度比較高的一個(gè)數(shù)字，是由夏威夷大學(xué)馬諾阿分校camilo mora教授提出來(lái)的：

    870萬(wàn)，不包括病毒。

    他是應(yīng)用生物分類階層——也就是生物課本里學(xué)過(guò)的界門(mén)綱目科屬種的數(shù)量趨勢(shì)，推估出出來(lái)的這個(gè)數(shù)字（/tent/113/21/5970）

    例如某動(dòng)物門(mén)=10綱=100目=1000科=10000屬=100000種，同時(shí)不同類群的分類階層數(shù)量有相似的趨勢(shì)，且高階分類相對(duì)于種較穩(wěn)定。

    因此經(jīng)過(guò)一系列的模擬，最終可推估得到較可信的總物種數(shù)。

    camilo mora教授的這篇論文是目前全球被引用次數(shù)最多的統(tǒng)計(jì)文稿之一，也算是個(gè)比較權(quán)威的推論了。

    870萬(wàn)對(duì)比200萬(wàn)。

    因此在青苔之中發(fā)現(xiàn)某種甚至多種微生物的存在，徐云真的一點(diǎn)兒都不驚訝。

    隨后他沉思片刻，對(duì)裘生道：

    “老裘，先做16s相似度檢測(cè)吧。”

    裘生點(diǎn)點(diǎn)頭，飛快的帶上套……手套，說(shuō)道：

    “行，我立馬就做?！?/br>
    一般來(lái)說(shuō)。

    如果是培養(yǎng)皿培育出的菌株，檢測(cè)或者對(duì)比的難度往往都不高。

    但對(duì)象若是自然界富集的樣本，cao作起來(lái)就比較麻煩了。

    徐云所說(shuō)的16s相似度檢測(cè)，指的是核糖體小亞基的rna組分檢測(cè)。

    也就是16srrna。

    這部分長(zhǎng)度大約1500nt，不同物種略有差異，算是目前主流的九大新物檢測(cè)步驟之一。

    五分鐘后。

    裘生抬起頭，對(duì)徐云道：

    “老徐，準(zhǔn)備好了，引物你覺(jué)得用啥？”

    徐云想了想，很快道：

    “1492r吧?！?/br>
    “好嘞！”

    半個(gè)小時(shí)后。

    裘生抬起頭，打了個(gè)響指：

    “搞定，擴(kuò)出來(lái)了，blast的密匙你有吧？”

    徐云朝他豎起一根大拇指示意干得漂亮，隨后走到cao作臺(tái)邊，噼里啪啦的輸了一大串密匙。

    做過(guò)新種檢測(cè)的同學(xué)應(yīng)該都知道。

    16s相似度檢測(cè)的界限其實(shí)有些模糊，因?yàn)椴煌诸惾旱臋z測(cè)相似度閾值是不一樣的。

    比如有的是97％，有的是99％。

    只是在通常情況下。

    相似度超過(guò)97％的，就可以認(rèn)為是一個(gè)物種。

    相似度低于97％的，就可以認(rèn)為是不同物種，進(jìn)行下一階段檢測(cè)。

    不過(guò)就是這樣一種不太精細(xì)的檢測(cè)手段，卻依舊是很多新物檢測(cè)邁不過(guò)去的一道坎：

    大部分樣本在經(jīng)過(guò)檢測(cè)之后，都會(huì)發(fā)現(xiàn)相似度在99.99％以上，與其他某某微生物是同一物種。

    總而言之。

    這項(xiàng)技術(shù)在定屬方面還是靠譜的。

    又過(guò)了一會(huì)兒。

    裘生一臉驚喜的抬起頭，聲音驟然拔高了幾分：

    “老徐，相似度46.9％，46.9％??！”

    “毫無(wú)疑問(wèn)，這是一類新物！”

    徐云認(rèn)真的看了他一眼，確認(rèn)道：

    “只有一種新物嗎？”

    “沒(méi)錯(cuò)，只有一種！”

    徐云若有所思的點(diǎn)點(diǎn)頭，又道：

    “那就繼續(xù)上磷脂脂肪酸和呼吸醌鑒定吧。”

    眾所周知。

    新物鑒定一般都有九個(gè)流程：

    1、16s相似度。

    2、形態(tài)學(xué)觀察。

    比如這個(gè)菌的形狀、大小、鞭毛情況等等，還包括最適生長(zhǎng)條件的確定。

    3、磷脂脂肪酸鑒定，這個(gè)具有屬特異性。

    4、呼吸醌，也就是看一下占優(yōu)勢(shì)的呼吸醌是哪種，這個(gè)有種特異性。

    5、分子雜交，也就是測(cè)定基因組序列，草圖就行，然后跟近源物種去比較。

    相似度超過(guò)70％是一個(gè)種，低于70％是不同物種。

    6、碳源利用情況，看一下能利用哪些碳源，一共有95種碳源的測(cè)試。

    7、api試劑盒鑒定，生理生化鑒定的一方面。

    8、gc含量。

    9、革蘭氏染色。

    大概經(jīng)過(guò)這些方面的檢查，就可以確定是不是新種了。（注：不知道這樣寫(xiě)的比較詳細(xì)大家愿不愿意看？這種詳細(xì)流程應(yīng)該沒(méi)有其他書(shū)寫(xiě)過(guò)，找人問(wèn)其實(shí)很麻煩的，要是還被嫌水下次我就不寫(xiě)了）

    其中第五個(gè)流程，也就是分子雜交這次可以直接忽略——畢竟第一部 測(cè)出來(lái)的46.9％實(shí)在是差距太明顯了。

    考慮到時(shí)間問(wèn)題，徐云將幾個(gè)步驟逐一分工，由幾位工具人……咳咳，課題組成員同步進(jìn)行。

    五個(gè)小時(shí)后。

    一道最終報(bào)告出爐了。

    “節(jié)叢孢屬的一類全新微生物，1000倍油鏡下可觀察到形態(tài)，體外具備大量假絲?！?/br>
    “這種假絲可以分離，與目標(biāo)結(jié)合完成某種化合反應(yīng)，這是……禿頭攻擊？”

    “一片青苔中可以高密度富集8000單位的極少量新物，特性上與嗜酸乳桿菌有一定類似……嗯？”

    隨后看著其中的一欄報(bào)告，徐云有些疑惑的抬起頭，對(duì)裘生問(wèn)道：

    “老裘，新物對(duì)食物殘?jiān)膬艋Ч顬槊黠@？”

    裘生點(diǎn)了點(diǎn)頭，指著不遠(yuǎn)處的一個(gè)培養(yǎng)皿道：

    “經(jīng)過(guò)我們的初步檢測(cè)，這種新型微生物可以有效遏制殘?jiān)邪睔?、有機(jī)酸和硫化物的生成?！?/br>
    “并且對(duì)奈瑟氏菌和厭氧鏈球菌之類的細(xì)菌，有著極強(qiáng)的殺傷力?！?/br>
    徐云微微一愣：

    “奈瑟氏菌和厭氧鏈球菌？”

    不過(guò)很快，他便反應(yīng)了過(guò)來(lái)：

    這兩種細(xì)菌，都是人體唾液和牙齦的標(biāo)準(zhǔn)分泌物之一：

    每一毫升的普通唾液里可以尋找出奈瑟氏菌8000萬(wàn)個(gè)，在每一克牙齦分泌物中更是可以尋找出10億個(gè)厭氧鏈球菌。

    在食堂里吐出骨頭啦、吐出西紅柿皮啦、吐出半截蛆蟲(chóng)時(shí)沾染上這些細(xì)菌，最后流入下水管道是很正常的事情。

    接著徐云指著報(bào)告，對(duì)裘生說(shuō)道：

    “老裘，新種只對(duì)食物殘?jiān)屯僖杭?xì)菌有效嗎？”